有哪些提取质粒DNA方法

生活经验034

本文目录

  1. 质粒提取的原理?
  2. 切割目的基因和质粒的注意事项?
  3. DNA如何进一步提纯?
  4. 提取RNA的详细步骤?
  5. 质粒提取各溶液组分的作用?

质粒提取的原理?

强碱性条件下,质粒DNA和基因组DNA同时从细胞中释放出来,并发生变性。

有哪些提取质粒DNA方法,第1张

在pH中性,并有高盐浓度存在的条件下,质粒DNA会迅速发生复性,仍为可溶性状态,染色体DNA之间交联形成不溶性网状结构,在去垢剂SDS作用下,染色体DNA与变性蛋白质和细胞碎片结合形成沉淀,通过离心去除沉淀后,再用酚氯仿抽提进一步纯化质粒DNA,用异丙醇或乙醇沉淀可将之纯化出来。

切割目的基因和质粒的注意事项?

切割目的基因和质粒是基因工程实验中的关键步骤。以下是在切割目的基因和质粒时需要注意的一些事项:

1. 工具酶选择:根据目标基因和质粒的性质选择合适的限制性内切酶。常用的限制性内切酶有EcoR I、BamH I、Hind III等。

2. 质粒准备:在切割质粒之前,确保质粒已经正确提取、纯化和转化。正确操作可以避免质粒被污染,从而提高切割效果。

3. 酶切位点分析:在切割之前,确定目的基因和质粒上的正确酶切位点。可以使用限制性内切酶预测工具(如PAGE或Primer Premier)进行分析。

4. 酶切温度和时间:根据所选限制性内切酶的特性,选择合适的酶切温度和时间。确保在适当的条件下进行酶切,以获得最佳效果。

5. 酶切产物纯化:酶切完成后,需要对酶切产物进行纯化。可以使用凝胶电泳、琼脂糖凝胶电泳或高效液相色谱等方法进行分离和纯化。

6. 质粒DNA提取:将纯化后的酶切产物用于质粒DNA的提取。选择适当的提取方法和试剂,以确保提取的质粒DNA质量良好。

7. 克隆和转化:将提取的质粒DNA用于目的基因的克隆和转化。确保使用正确的转化方法,并注意无菌操作。

8. 下游实验:在切割和转化成功后,进行后续实验,如PCR、酶切鉴定和基因表达分析等。

9. 实验操作:在整个实验过程中,遵循实验室规定和操作规程,确保实验环境安全和生物安全。

10. 数据分析:在实验完成后,对结果进行详细分析,评估切割和转化效果。如有需要,可以调整操作条件以优化实验效果。

DNA如何进一步提纯?

一般来说,OD比小于1.8的话是有残余蛋白,小于1.7的话这里面东西DNA就不多了,很可能是裂解液有问题,碱性裂解液较强烈,一般没问题,可以参考分子克隆里提取质粒的方法配制裂解液,如果你不死心的话,先可以用你提的东西跑个电泳看下,看有没有基因组,有的话那就用DNA凝胶提取试剂盒吧。。

提取RNA的详细步骤?

分子克隆技术(华农)实验一 质粒的制备质粒是携带外源基因进入细菌中扩增或表达的主要载体,它在基因操作中具有重要作用。质粒的分离与提取是最常用、最基本的实验技术。质粒的提取方法很多,大多包括3个主要步骤:细菌的培养、细菌的收集和裂解、质粒DNA的分离和纯化。本实验以碱裂解法为例,介绍质粒的抽提过程。实验目的:掌握碱裂解法抽提质粒的原理、步骤及各试剂的作用。实验材料:含有质粒pUC18载体的大肠杆菌菌液,克隆有水稻外源片段的BAC的大肠杆菌菌液。 实验原理:在pH 12.0 ~ 12.6碱性环境中,细菌的线性大分子量染色体DNA变性分开,而共价闭环的质粒DNA虽然变性但仍处于拓扑缠绕状态。将pH调至中性并有高盐存在及低温的条件下,大部分染色体DNA、大分子量的RNA和蛋白质在去污剂SDS的作用下形成沉淀,而质粒DNA仍然为可溶状态。通过离心,可除去大部分细胞碎片、染色体DNA、RNA及蛋白质,质粒DNA尚在上清中,然后用酚、氯仿抽提进一步纯化质粒DNA。实验步骤:

1. 取含有pUC18质粒的大肠杆菌菌液于LA培养基上37℃过夜培养;

2. 用无菌牙签挑取单菌落,接种于含有Amp抗生素的LB培养基中,37℃摇床~250 r/min过夜培养;3. 吸取1.5 ml菌液,12000 g离心2分钟,收集菌体,倒掉菌液;吸取1.5 ml菌液,再次收集菌体,尽量将菌液倒干净;4. 加入300 ml溶液 I振荡打匀,重新悬浮细胞,震荡混匀(注意:应彻底打匀沉淀或碎块); (剧烈)

5. 加入300 ml溶液II,轻柔颠倒混匀,放置至清亮,一般不超过5分钟;6. 加入300 ml溶液III颠倒混匀,放置于冰上10分钟,使杂质充分沉淀;(温和)

7. 12000 g离心10分钟;8. 吸取800 ml上清液(注意:不要吸取到飘浮的杂质)至另一Eppendorf管中,加入2/3体积的异丙醇,室温下放置5分钟;9. 12000 g 常温离心15分钟;

10. 倒尽上清,加75%乙醇浸洗除盐(放置片刻或离心3分钟后倒去上清);11. 室温放置或超净台上风干DNA;12. 加40 ml灭菌超纯水或TE溶解;13. 质粒、BAC的质量检测,于-20℃保存。附注:质粒检测电泳检测:质粒电泳一般有三条带,分别为质粒的超螺旋、开环、线型三种构型吸光值检测:采用分光光度计检测260nm、280nm波长吸光值,若吸光值260nm/280nm的比值介于1.7-1.9之间,说明质粒质量较好,1.8为最佳,低于1.8说明有蛋白质污染,大于1.8说明有RNA污染。实验二 DNA的琼脂糖凝胶电泳带电荷的物质在电场中的趋向运动称为电泳。电泳的种类多,应用非常广泛,它已成为分子生物学技术中分离生物大分子的重要手段。琼脂糖凝胶电泳由于其操作简单、快速、灵敏等优点,已成为分离和鉴定核酸的常用方法。实验目的:掌握琼脂糖凝胶电泳的原理,学习琼脂糖凝胶电泳的操作。实验材料:质粒DNA、BAC、植物总DNA

质粒提取各溶液组分的作用?

solution1就是提供一个裂解菌体的溶液~有一些蛋白质变性剂去垢剂葡萄糖做调解渗透压的作用~

solution2就是碱性的致使核酸(基因组DNA加质粒DNA)发生变性的溶液~solution3就是用来中和2的碱性的溶液~使得质粒可以复性而基因组DNA则不能~所以经离心就可以把质粒分离开来了~