不同于一般的歌剧叙事按照时间顺序娓娓道来，《红船》在文学结构上采取多重回环往复式的结构，沿着主线“红船”向前推进。全剧以红船的5次出现为时间的主轴，在主轴上编织着8次回环往复的事件，其中包括五四运动、驱张运动、营救陈独秀等历史事件。会上和会外相结合，多场面、多层次地把中共一大之前的若干重大史实、重要人物勾勒出来，集体回眸历史纵深处的中国共产党开创者群像，陈独秀、李大钊、毛泽东等近20位早期共产党人角色，首次在歌剧舞台上同台亮相。
《红船》选择了非线性的叙事方式，这些片段化的结构如何整合在一起？总导演黄定山带领团队前后做了5个方案，最终采用18块3米宽、10米高的大板，在舞台上不断变化，通过推拉帷幕、投影、灯光的有机运用，形成蒙太奇式的转换，虚实结合，营造出具有逼真代入感的戏剧场景。剧组还在场上做了两个转台，直径18米的大转台套着9米的小转台，带动50个场景和空间，把多个历史瞬间流畅地呈现在观众眼前。
音乐是歌剧创作非常关键的一环。此次担纲《红船》作曲的作曲家孟卫东，将西洋歌剧和民族歌剧相结合，独唱、合唱、重唱各显神通，大调、小调、离调交替更迭，宣叙、咏叙、咏叹运用自如，人物主题音乐鲜明，层次变化异常丰富。剧中的《我有一个梦》《万岁》《一个幽灵》《启航，驶向远方吧》以及毛泽东与杨开慧相爱、细妹子诉说苦难和船娘等多个精彩唱段，既有恢宏气势，又细腻柔婉、诙谐幽默，饱含丰富的戏剧性表达，充盈着令人动容的情感共鸣、红色激情和信仰力量。
