一、用途上的不同：
1、庙是供鬼神的，皇帝祭他的祖先叫太庙，普通老百姓的叫祠堂，供养鬼神的地方称为庙。
2、寺是一个办理佛陀教育的机构，如今政治制度变了，但这个名称一直没有变，形式也没有变。
二、分类上的不同：
1、寺院若依创设者而分，可分成官寺（由官府所建）、私寺（由私人营造）。
若依住寺者而分，乃有僧寺、尼寺之别。
若依宗派，则分为禅院（禅宗）、教院（天台、华严诸宗）、律院（律宗）或禅寺（禅宗）、讲寺（从事经论研究之寺院）、教寺（从事世俗教化之寺院）等类。
2、奉祝皇族祖先灵位者称为太庙，世家或富豪宅邸内奉祀祖先处称为家庙。后有祭祀圣贤者，如祭祀孔子者称文庙或先师庙，祭祀武人者称为武庙。
