12个限时挑战位置分别是第1个挑战位置:鹤观最右边神像下面,完成条件:在40秒收集6个雷微粒,奖励:精致宝箱
第2个挑战位置:茂知祭场传送点上方石台上,完成条件:在80秒内收集9个雷微粒,奖励:普通宝箱
第3个挑战位置:茂知祭场文字旁,完成条件:在120秒内收集12个雷微粒,奖励:普通宝箱借助雷种子
第4个挑战位置:菅名山南方向山腰完成条件:120秒内开启宝箱奖励:精致宝箱借助3波雷种子
第5个挑战位置:菅名山山顶完成条件:在120秒内收集13个雷微粒奖励:精致宝箱中间借助雷种子
第6个挑战位置:逢岳之野正南方完成条件:在70秒内击败所有敌人(0/3)奖励:精致宝箱
第7个挑战位置:逢岳之野西南方完成条件:在40秒内收集7个雷微粒奖励:普通宝箱
第8个挑战位置:逢岳之野字体旁完成条件:在30秒内引爆炸药桶(0/4)奖励:普通宝箱
第9个挑战位置:知比山传送点西南方悬崖上完成条件:30秒内开启宝箱奖励:珍贵宝箱穿越相位之门(先去地灵龛调整下相位之门的方向)
第10个挑战位置:知比山传送点右边山脚完成条件:在50秒内击败所有敌人(0/3)奖励:普通宝箱
第11个挑战位置:知比山地下东北方完成条件:在70秒内击败所有敌人(0/4)奖励:珍贵宝箱需要拿羽毛(完成【雾海纪行】第二阶段:【雾海纪行】:倾听木簧笛的八音曲)照旁边的鸟刻像,拿雷种子(30级)进入雷屏障,挑战击败敌人解除宝箱封印。
第12个挑战位置:知比山地下西边完成条件:在120秒内击败所有敌人(0/3)奖励:珍贵宝箱,先用羽毛照壁画处的雷鸟石雕,解谜火把,开启宝箱,再用羽毛照有五颗幽灯蕈的壁画那边刻雷鸟石雕,开启机关,水位下降,进去找到限时挑战。