刺客信条小说的顺序大致为原则性与编年史。首先是原则性，包括《刺客信条：再生》、《刺客信条：异端》等作品，这些小说讲述的是刺客与圣殿骑士之间的斗争。
其次就是编年史，分为两类：
编年史P和编年史R。编年史P是叙述“Desmond”故事的，而编年史R则是前往罗马寻找“埃吉奥”的故事。小说按照时间顺序为：
1.《刺客信条：再生》
2.《刺客信条：异端》
3.《刺客信条：起源》
4.《刺客信条：揭示》
5.《刺客信条：雷神之锤》
6.《刺客信条：繁荣》7
.《刺客信条：背叛》
8.《刺客信条：觉醒》
9.《刺客信条：裔生》
10.《刺客信条：兄弟会》
11.《刺客信条：黑旗》
12.《刺客信条：叛变》
13.《刺客信条：圣殿骑士》
14.《刺客信条：旗帜》
15.《刺客信条：爆破》
16.《刺客信条：灵魂》因此，作品排列并不是按照一个唯一的时间线来组织的，而是根据不同的阶段和人物而分成了不同的章节。
