伏羲与东华帝君没有直接关系。
伏羲，华夏民族人文先始，三皇之一，亦是与女娲同为福佑社稷之正神。楚帛书记载其为创世神，是中国最早的有文献记载的创世神。风姓，又名宓羲、庖牺、包牺、伏戏，亦称牺皇、皇羲、史记中称伏牺，在后世与太昊、青帝等诸神合并，在后世被朝廷官方称为"太昊伏羲氏"，亦有青帝太昊伏羲(即东方上帝)一说。燧人氏之子， 生于成纪，定都在陈地。 所处时代约为旧石器时代中晚期。伏羲是古代传说中的中华民族人文始祖，是中国古籍中记载的最早的王，是中国医药鼻祖之一。
东华帝君（东华紫府少阳君）是唐七公子所著小说《三生三世枕上书》及其衍生作品中的角色，是上古神祇、天地共主。 东华帝君定仙神律法、掌六界生死，其身着一袭紫衫、皓皓银发、目光清冷、无情无欲。他避世数十万载，一直生活在三清幻境的菩提净土，与青丘帝姬凤九经历了三生三世的爱恨纠葛，可为凤九剖心为证，终成眷属。
